שאלון החקר הינו בחינה בכתב לתלמידים אקסטרנים ולנבחני משנה. תכני הבחינה זהים לאלו של מעבדת החקר למעט ביצוע הניסוי בפועל. את תוצאות הניסוי יפיק התלמיד מתיעוד מהלך הניסוי המתואר בשאלון (מומלץ לעיין בשאלונים משנים קודמות). על התלמידים לפנות לבית ספר אקסטרני כדי להירשם לבחינת בגרות זו.
הרישום לבחינת הבגרות בשאלון החקר מחייב את הנבחן לפנות לבית ספר על מנת שיזמין עבורו את השאלון. תלמידים אקסטרנים יזמינו את השאלון במסגרת בית ספר אקסטרני.
נבחני משנה יזמינו את השאלון בבית הספר בו סיימו את לימודיהם לבגרות.
תאריך אחרון לרישום התלמידים והזמנת השאלונים (036382) דרך המנבסנ"ט נקבע ע"י אגף הבחינות. בדרך כלל התאריך האחרון להרשמה הוא במהלך חודש פברואר.
